В августе 2013 года в Федеральную антимонопольную службу (ФАС России) поступили заявления от грузоотправителей, указывающие на признаки нарушения ОАО «РЖД» антимонопольного законодательства. Недовольство вызвал Совместный порядок организации комиссионной проверки грузов, который применялся монополистом.